第三届中美肿瘤诊断病理高峰论坛圆满落幕
年9月1日至3日,第三届中美肿瘤诊断病理高峰论坛在中医院圆满召开。本次会议由国家癌症中心和全美华人病理医师协会(CAPA)主办,联合了北京医学会病理学分会,中国抗癌协会病理专业委员会,中华医学会病理学分会等多个专业学会。本次大会由来自美国LoyolaUniversityMedicalCenter的唐平教授和中医院的吕宁教授担任主席。来自中美肿瘤病理界的50多位大咖应邀参加了此次高峰论坛并在会上做了精彩的报告。
燃石医学首席技术官张之宏博士应邀在本次会议分子病理专场上做了“NGS新一代建库技术的应用”的主题报告。
(燃石医学首席技术官张之宏博士演讲)
NGS新一代建库技术的应用
近年来,随着NGS技术的发展,二代测序成本已经越来越低,在肿瘤分子病理中的应用也越发成熟,但是NGS建库技术在处理FFPE样本和ctDNA等具有挑战性的样本的时,仍然有很多进步的余地。张之宏博士从怎样提高文库转化率,降低测序背景噪音,减少文库偏好性,提升试验操作的简便性这四个方面回顾了在过去的一年中燃石的研发团队做出的卓越努力,使得燃石在新技术的临床转化上始终走在行业前列。
燃石自主研发的HS建库技术,能够显著增加FFPE样本及ctDNA的文库转化效率,在面对低质量DNA(FFPE样本)与低提取量的DNA(ctDNA样本)有着更好的宽容度,在相同的测序深度下相比传统的建库方法有着更高的检测灵敏度。这项技术已申请国家专利。
UMI技术是燃石开发的基于分子标签的NGS降噪技术,这一技术能够帮助有效区分NGS检测数据中,哪些是真实世界中存在的DNA突变,哪些是因为DNA损伤导致的假阳性。Illumina测序仪的系统误差在0.1%左右,而在早期肿瘤中,突变丰度在多数情况下都低于0.1%。如果需要对这些低于0.1%的突变事件进行检测,就需要使用UMI技术来提升检测的信噪比,这也是推进ctDNA用于早期肿瘤检测的一个必要的技术手段。
针对早期肿瘤的另外一个检测路径是进行肿瘤基因组的甲基化检测,在检测敏感性方面,甲基化检测相对于突变检测有着更好的表现。张之宏博士也对燃石在这方面的工作做了简要的介绍,并请大家北京治疗最好白癜风的医院北京中科白癜风医院
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